Total Commander

[sa]

MilitaryPT
Если набор изменившихся файлов для всех каталогов будет одинаковым, то можно запустить синхронизацию только для одного каталога, затем в диалоге, открывающемся после нажатия кнопки Синхронизировать, выбрать какой-нибудь промежуточный каталог, куда и скопировать набор изменившихся файлов.
А затем уже этот набор скопировать во все папки Metadata, например, найденные поиском по Alt+F7 и выведенные на панель. В диалоге копирования, включить опцию "копировать во все выделенные папки/ссылки целевой панели".