Total Commander

[Avada]

Snake
Настройки TC действительно по умолчанию одни на всех. Но вот где эти настройки лучше держать —зависит от операционной системы и от наличия/отсутствия у пользователей прав доступа к тем или иным каталогам. А задать вопрос так, что даже непонятно, о каких настройках вообще речь — TC или системы, это, конечно, постараться надо. До уточнения вопроса больше тут говорить не о чем.

Flasher
Не обязательно в корне TC. По умолчанию (по XP включительно) — в папке Windows. При установке (или потом) могут задаваться и другие варианты. А ключ InstallDir при нормально выполненной инсталляции просто дублирует информацию в реестре о каталоге установки TC, а не о размещении файлов конфигурации. Но, опять же, до уточнения вопроса обсуждать это дальше смысла нет никакого.
_________________
Даже самая богатая фантазия
Не представит себе наши безобразия.