Подтверждаю, что при значении 4 независимо от состояния опции отображения скрытых файлов в панелях синхронизатор их показывает. Но тут скорее всего логика в том, что присутствует 0 - всегда показывать. Согласен, выглядит невнятно.
При значениях 5 и 6 в моих экспериментах тоже все с точностью до наоборот. Надо репортить баг Гислеру.