Total Commander

[kadvlad]

Не уверен, что правильно понял задачу, но навскидку:
разве плагин diskdir не для этого предназначен?

Создаём на рабочем компе файл-список директорий, переносим домой, и там сравниваем его (с помощью команды cm_CompareDirs) с результирующим каталогом.

Только что попробовал:
скопировал каталог на другой диск, удалил из него несколько файлов, создал lst-файл.
Затем сравнил исходную директорию с этим файлом -- увидел отличающиеся файлы, синхронизировал.
Не то?