Total Commander

[Flasher]

Кстати, я ошибся. Я дал ссылку, где показываются различные способы копирования структуры пустых папок.
А ТЗ должно выглядеть так: копирование содержимого выделенных папок в один каталог с сохранением структуры.

Скриптом и батником реализовать, конечно, можно. Внутренних команд подобного формата, естественно, нет.
Если бы в корнях выделенных папок были бы только подкаталоги, тогда этот момент осуществлялся легко с выделением нужных директорий в дереве( Ctrl+F8 ) и копированием в другую панель.